蛋白质饲料对养鱼显得特别重要。因为鱼类要求饲料蛋白质含量较高，为30%-50%。所以饲料中蛋白质含量不足，对鱼类生长影响很大。目前生产上广泛应用的蛋白质饲料有：植物性饼类——由机榨工艺榨油的副产品，植物性粕类——由浸提工艺加工油脂的副产品。一般情况下粕类的饲用价值优于饼类。此外，动物性蛋白质饲料（如鱼粉、肉骨粉、发酵血粉等）也广泛应用。
（1)豆饼（粕）。属植物性蛋白质饲料，蛋白质含量为42%左右。它是饼（粕）中蛋白质品质较好，利用率较高的一种，含有丰富的氨基酸。特别是鱼类所需的赖氨酸和精氨酸含量较高。使用时，在其中添加适量的合成氨基酸（主要是蛋氨酸）可以获得较好的使用效果，而且可以降低部分鱼粉用量，以降低饲料成本。
生豆饼中含有抗胰蛋白酶、皂角素等有害物质，适当加热以后可将这些有害成分破坏。但加热时温度要适当，一般为140℃-150℃以下加热2分30秒，若温度过高也会降低豆饼中氨基酸的利用率。在油脂加工时，有一次浸出工艺和二次浸出工艺之分，一般地一次浸出粕优于二次浸出粕。
从市场上采购豆粕时，应注意豆粕含水量、杂质含量及豆粕的生熟度，其生熟度可以通过颜色、气味来初步判断。适度加热的豆粕具诱人的香味，颜色为黄橙色。准确判断应通过化学分析检测。
(2)棉仁饼、菜籽饼（称为两饼）。两饼也属于植物性蛋白质饲料。其蛋白质含量受油脂加工工艺及去壳情况的影响。去壳榨油后的棉仁粕和菜粕蛋白质含量与豆粕的蛋白质含量接近，但其可利用率低于豆粕。
棉仁饼中的棉酚对动物有毒。鱼对棉酚的敏感程度虽不及猪、鸡，但也较易遭受毒害，饲料中应用棉粕可进行物理或化学法去毒（鞍为有效的方法是硫酸亚铁法），也可采取限量饲喂（在饲料中控制用量8%～10%,以内），间歇饲喂（喂7天停2天～3天）或搭配使用等措施，以减小或消除棉酚的毒性。
荣粕中含有多种有毒成分，主要来源于芥苷（可分解成为有毒物质）。目前市场上已有菜粕的解毒剂，如浙江农业大学许梓荣教授研制的6107菜粕解毒剂，可减轻菜粕的毒性。
除上述饼粕以外，还有芝麻饼、花生饼等也可作为鱼饲料中植物性蛋白质的来源。
(3)鱼粉。鱼粉属动物性蛋白质饲料，含有较高的蛋白质，且其中某些必需氨基酸含量丰富。此外，在鱼粉中还有一些未知的促生长因子。因而在饲料中应用鱼粉可显著地起到促进鱼类生长的作用。
鱼粉由低质鱼或鱼品加工副产品制成，属应用广泛的动物性蛋白质饲料。世界上鱼粉的主要生产国是秘鲁、智利和日本。近几年来-随着海洋渔业资源的减少，以及鱼粉需要量增加，鱼粉价格持续上涨，所以在使用时应主要考虑价格对养殖成本的影响，用量一般不超过5%-8%。
一般内陆地区（如河南省）、无自产鱼粉，均由外地或国外引进，由饲料、粮食、外贸部门经营。在选购鱼粉时应注意鱼粉的质量，尤其是掺杂使假的问题。鱼粉掺假主要是在鱼粉中掺人棉粕等植物性饲料和尿素。
鱼粉的质量：颜色，黄棕色或黄褐色，昧•无异臭及焦灼味•能通过2.8毫米标准筛网的比例至少为日98%。此外，还有关于盐分、砂分、粗脂肪等方面的要求。
(4)肉粉、肉骨粉。肉骨粉是屠宰场在进行肉类加工时的废弃物，包括不能食用的内脏、杂骨、胚胎及经病死的畜禽（消毒）加工而成。肉粉含蛋白质较高，但是其利用率较低，易对其用量造成限制。此外，应对皮革下脚料加工成的肉粉有所区别，由于在其中含大量角质蛋白和鞣酸，因而其利用率较差，且大量鞣酸对鱼类饲养不利。
肉粉及肉骨粉有专门的生产厂家，质量较好的肉粉或肉骨粉外观呈灰黄色或深棕色，无异臭味。
(5)酵母类。目前渔业研究应用的酵母大致有啤酒酵母、饲用酵母和石油酵母，以前两种居多。
啤酒酵母和饲用酵母均含有丰富的B族维生素，富含蛋白质（含有多种酶），消化率较高，因而是鱼类饲料中良好的蛋白源。
但是，目前市场销售的酵母粉产地、种类较繁杂。选购时应注意其质量，包括蛋白质含量、有害细菌繁殖情况等，可通过试用确定选用哪种酵母饲料。根据我们所掌握的情况，北京圣格生物技术开发公司生产的PSC饲料蛋白，河北省沧州生物饲料厂等厂生产的饲用酵母应用效果较为理想。特别是对鲤鱼等效果较好。
