目前危害对虾养殖的主要流行病是白斑杆状病毒(ws—BV)或称皮下及造血器官坏死杆状病毒(HHNBV)。另外尚有斑节对虾杆状病毒病(MBV)、对虾中肠腺细小病毒(HPV)、黄头杆状病毒(YBV)、呼肠弧病毒(RLV)以及立克氏体、支原体、细菌等引起的疾病。这些病一旦发生是难以治疗的。关键在于预防，防重于治应是长期的战略方针。目前我国对对虾防病主要有如下几条途径：
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(1)封闭式隔离途径：这是使病原体与对虾隔离，免受其感染。为达此目的，首先应使用不带致病病毒的虾苗，养成池及养殖用水均应彻底消毒，不投喂带有病毒的鲜活饵料等隔离措施。这种方法在大面积生产中尚存在操作上的问题，而且目前尚难以有把握地生产无病毒的虾，因此，应用受到一定限制。
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(2)优化养殖条件，提高对虾抗病能力：这主要是为对虾创造一个优良的环境条件，提供优质饵料，增强对虾的抗病能力，减少刺激因子，避免对虾发病。实践证明这是一条有效的防病途径，即便是对虾受到病毒感染，仍可以不发病而继续生长。例如泰国的养虾模式，对虾的产量可达5-10吨／公顷，我国湛江地区利用该法养殖，斑节对虾单产可达6-7.5吨／公顷。青岛一个养虾户利用优质卤虫为饵料，连续两年对虾1/15公顷产量在300千克以上。
(3)生态防病：生态防病是利用生物群落之间相互作用，保持虾池内生态系的平衡，从而起到防病之目的。例如培养基础饵料，保证幼虾饵料供应；进行虾、贝混养，消耗过多单细胞藻类，保持良好水质；适量混养肉食性鱼类，特别是不很凶猛的2龄黑鲷、河鲀及当年的矛尾嘏虎鱼等，它们捕食健康虾的能力差，主要捕食一些活动力差的病、弱虾，从而阻止了虾病的传播，起到了防病之作用。有的文章还报道，饲养河鲍鱼的水，再养对虾时，可提高对虾血细胞吞噬率、杀伤率及吞噬指数，有提高对虾免疫功能的作用。他们在东方鲀、真鲷与对虾混养时，1/15公顷产东方鲀68.6千克，真鲷48.2千克，对虾129.2千克，起到了较好的防病效果。
