接种后的栽培袋要放在适宜条件下进行培养。培养室要求通风、干燥、便于遮光。为了防止杂菌感染，培养室事先最好用甲醛和高锰酸钾进行熏蒸消毒，四壁及地面和床架可喷洒石灰水或0.1%的多菌灵药液消毒，必要时地面上还可撒一层石灰粉。
接种好的栽培袋可直接摆放在培养室床架上，这样不仅可以增加摆放量，而且便于控制温度和通风：若没有床架，也可以直接摆放在培养室地面上。在培养室地面上摆放时，菌袋可成排码起，堆高4-6层，每排之间要留有50厘米的走道，便于通风和管理人员活动。温度高时还可呈井字形摆放，以利于降温和通风。若温度和光照条件适宜，接种后的栽培袋也可直接摆放在室外棚室内培养，以减少菌袋的搬动。
菌丝体生长阶段是决定栽培成功率和能否获得优质高产的关键时期，管理的重点是控制温度、保持湿度，促进菌丝的生长，严防杂菌的发生和蔓延。
①温度。温度是平菇生长发育的关键因素。在菌丝体生长阶段要求温度较高，且要恒温。所以，在此阶段培养室的温度应控制在20℃ -22℃，栽培袋料温控制在22℃ -24℃。当料温超过25℃时，应立即采取降温措施。培养室内发菌的应打开门窗和通风口通风换气，必要情况下可适当洒水降温，也可翻堆或将栽培袋散开降低料温；室外棚室内发菌的，应在白天温度高时覆盖并加厚草帘，防止阳光直射，同时打开通风口和门窗通风换气。当温度较低时，培养室可采取安装暖气、电炉、煤炉等措施加温，但不可直接明火加温，一定要有烟道；棚室内应设法在每天室外温度高时揭开草帘升温，夜间覆盖草帘保温，效果不理想时，也可采取暖气、电炉、煤炉等措施加温。
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②湿度。菌丝体生长阶段的湿度管理主要包括培养料的含水量和培养室内空气相对湿度两个方面。培养料的含水量在装袋时已调整好，此期不再调整。此期的管理重点是培养室内的空气相对湿度。培养室内的空气相对湿度一般应保持60%左右，宜低不宜高，过高，易发生杂菌，当空气相对湿度过高时，应打开门窗及通风口进行通风换气，降低湿度。后期可适当增加空气相对湿度，使之达到65%-70%．避免干燥的空气过多地降低栽培料的湿度。
③空气。平菇属好气性真菌，在菌丝体生长发育阶段需要有充足的氧气供应。虽然平菇在菌丝体生长阶段菌丝耐受二氧化碳的能力较强，但菌丝在生长过程中不断放出的过多的二氧化碳和其他废气，会阻止菌丝体正常生长发育，所以在菌丝体生长阶段培养室要定期通风换气，保持空气新鲜。尤其生长后期，更应该注意加强通风换气。一般每天通风2-3次，每次30-40分钟。通风换气还要结合温度和湿度情况进行，当温度低湿度小时，尽量少通风；当温度高湿度大且栽培量大时，应增加通风次数，延长通风时间。
④光线。在菌丝体生长阶段一般不需要光线，菌丝在弱光和黑暗条件下完全能正常生长，所以培养室内光线宜弱不宜强。因此，在培养室内发菌的门窗应挂布帘遮光：在室外棚内发菌的应覆盖草帘、报纸或用遮阳网遮光．
⑤生长检查。菌丝生长过程中要定期翻堆，查看菌丝生长状况，同时还要检查有无杂菌污染。翻堆一般每周一次，如果料温过高可随时翻堆，翻堆时要上、下、内、外调换位置，以保持栽培袋承受压力一致和袋内温度一致，有利于菌丝均匀整齐生长。翻堆同时要检查有无杂菌污染，一旦发现杂菌污染，应及时拣出和除治，对杂菌污染较轻的栽培袋，可用浓石灰水涂抹污染处后，置较低温度下(l0℃以下)缓慢培养。如果杂菌污染严重时，应及时淘汰，不可乱放。为了防止杂菌发生，特别是在高温季节，培养室内可定期向空间喷洒0.1%-0.2%的多菌灵药液，或3%的漂白粉溶液和气雾消毒剂等，以杀灭杂菌和害虫，降低室内杂菌基数。
正常情况下，30天左右菌丝即可长满栽培袋，进入出菇管理阶段。
