茶子包装前要进行消毒。不同品种的茶子应分别包装运输，各品种茶子都应做好明显的标记，以便识别，避免混杂，大量茶子运输前还要进行发芽率的测定。
茶子包装方法应根据运输距离和估计途中耽搁时间的长短而决定。短途运输的茶子，可直接装入麻袋、竹筐、草袋或木箱等简单包装材料内运输。每袋（箱）茶子净重以不超过25千克为宜。远距离运输茶子，因途中耽搁时间长，必须用木箱包装。
一般木箱规格是：箱长60厘米，宽35厘米，高30厘米。为使木箱在堆叠时不致气孔堵塞，木箱四周可用木板条作箱脚，木板条厚1.5厘米。这样的箱子约可装净茶子20千克。茶子装箱时要加入填充物，使茶子不致流动。填充物的种类很多，一般有用干净的木屑（水量不超过10%-15%）加木炭屑的混合物；也有用木炭屑和红土（表土以下15厘米的心土，经8毫米直径筛孔的筛子筛过，取出筛下的细土，经150℃高温炒10分钟-15分钟）的混合物（木炭屑60%，细红土40%）。填充物和茶子要分层堆放，通常每层约放茶子2.5千克，一层填充物上面放一层茶子，这样间隔装放，共放7层-8层。另外，茶子箱内用细沙代替木炭屑红土混合物作填充物的，效果也很好。
如航空运输茶子，为了减轻重量，填充物可用洁净干燥的青苔，每箱约放青苔1千克-1.5千克，分5层装放，每层放入青苔约5厘米厚，每层放茶子4千克。为了使箱内能保持适当通气和便于散热，要在箱的四周边上钻一些小孔（气孔大小以茶子不会漏出为度）。
另外，在箱内横放一个用竹筒（竹筒上钻若干小孔）做成的通气筒，竹筒两端顶住箱板，并在竹筒两端的箱板上各开一个较大的通气孔，孔的直径为2.5厘米-3.5厘米。
茶子装箱后即起运，并尽量避免途中耽搁积压，运输时间最好不超过1个月。茶子袋、箱不宜压叠过紧，运输途中切勿受雨淋日晒，船运要防止水浸受潮。
