(1)空气湿度高，注意病害发生。棚室的气密性好，提高了温度，同时也增大了棚室内的湿度，特别在低温期，极易使作物表面结露或吐水，为真菌、细菌性病害的发生、发展创造了条件。如低温高湿时容易发生灰霉病、细菌性角斑病、霜霉病等，高温高湿时易发生叶霉病等，这些已成为棚室蔬菜的主要病害。在保温的基础上，通风排湿，减少棚室内结露时间和结露量，是病害综合防治措施中的首要一条。
(2)土地轮作困难，注意土传病害的防治。由于棚室面积有限及栽培品种单调，给蔬菜倒茬轮作带来困难，有相当一部分棚室多年连作一二种蔬菜，不仅造成土壤营养不良，而且使土壤中病菌量增多，土传病害猖獗，如黄瓜枯萎病、茄子黄萎病及根结线虫等，严重影响蔬菜的生长。因此，要重视轮作倒茬、重视清洁和消毒土壤，以减少病害的发生和发展。
(3)土壤盐渍化严重，注意合理施肥。棚室中的土壤养分不会随雨水流失，加之化学肥料用量较大，致使土壤中盐离子浓度升高，盐渍化严重，根的渗透压增大，影响了根对水分、养分的吸收而造成盐害。为了防止盐渍化，应尽量多施有机肥料，测土配方使用化肥，少施氯化物和硫化物类化肥，并应采取条施或穴施，避免表面撒施。施用氮素化肥时应采用穴施或开沟施，然后覆土浇水，并加强通风，预防氨气中毒。施入的有机肥要完全腐熟。如发现出现盐害，可用大水或雨水冲洗土壤中积存过多的盐分。
(4)光照强度低，注意改善光照条件。棚室的结构设计、骨架及覆盖的塑料薄膜等，是影响光照强度的主要因素。要经常清扫或清洗棚膜、覆盖草苫的温室，更要清扫膜面的草屑和灰尘。大棚膜一般可用柔软的粗麻绳，两人分别站在东西两边拉动麻绳，来回擦抹薄膜表面，并用自来水喷洒，冲洗灰尘。棚室内应尽量减少支柱，棚室采光角要适当，以增加采光量。在栽培上尽量选择耐弱光品种，种植密度要适宜，并利用搭架或吊蔓栽培，随时摘除底部的黄、老、病等无效叶片，及时绑蔓、打权，充分利用棚内的有限光照。
(5)投资多，成本高，注意精耕细作提高效益。棚室栽培蔬菜投资多、成本高，要及时掌握市场动态，科学调整种植结构和技术，充分利用土地和空间，加强栽培管理和病虫害的防治，压缩一切开支，夺取蔬菜高产、优质，以期获得最好的经济效益。
