烧根、沤根、冷害和高温烧苗是苗期的生理病害。它们不同于由病菌引起的病害，一般用防病药剂是无效的，必须通过调控环境条件才能防止和缓解。
(1)烧根。由于施肥量（特别是氮素化肥）过多，床土干旱，施用未腐熟的有机肥而对秧苗根系造成伤害，表现为根尖发黄，须根少而短，不发新根，但不烂根，地上部叶片小，叶面发皱，叶色暗绿，边缘焦黄，植株矮小，严重时秧苗成片死亡。防止措施是：施用化肥不能过多且施用要均匀，尽量使用腐熟有机肥。当发生烧根现象时，可适当多浇水，降低床土中的肥料浓度，或重新换床土移栽。
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(2)沤根。沤根是由于苗床土壤水分经常处于饱和状态，土壤湿度过大，缺少空气，且长期低温、光照不足造成的。症状是根系沤烂，苗易拔起，地上部分停止发育，叶色灰绿，逐渐变黄，直至全株死亡。防止措施是：通过加温等方法提高床温；控制苗床浇水量。在必须浇水时，应根据床土干湿情况按片浇灌温水，不要大水漫灌。如发生沤根，应暂停浇水，及时通风排湿，增加蒸发量，或覆干土吸湿，或者松土透气。
(3)冷害。长期0℃以上的低温或温度在0℃以下对秧苗的伤害，表现为秧苗生长缓慢，根系发育不良，叶色暗绿或发黄，叶片卷曲萎蔫，甚至整株似水烫状死亡。如果低温的伤害不严重，可在减少直射光的情况下，少量喷些水后，逐渐提高气温，还可以便秧苗恢复生长。
(4)高温烧苗。这种现象尤其在塑料薄膜小拱棚中发生较多，随着日光的照射变化温度变化剧烈，晴天中午不放风时可升至50℃以上，烤坏秧苗，轻者失水萎蔫，重者叶片有明显的褐色灼伤斑，甚至很快整株猝倒，不能恢复而死亡。在早春育苗中，不仅要注意防寒，同时也应防止高温危害，特别是果菜秧苗，即使苗未烤死或烤伤，只要温度高于35℃较长时间，花芽的发育就会受到伤害，对植株正常发育及产量均有明显影响。防止的措施主要是控温，适当遮荫、通风，也可少量喷水。
