1、封闭管理，为防止外部病菌、虫卵等的传入，对有机蔬菜生产基地相对封闭管理。2、加强检疫，防止农作物病虫草害随同农作物的产品、种子、种苗扩散而传播的一整套措施。3、加强病虫害的预测预报，蔬菜病虫草害的发生，都有其可循的自然规律和相应的环境条件。4、选用抗病虫品种，必要时对种子、种苗进行消毒处理。
一、封闭管理
为防止外界病菌、虫卵等传入，对有机蔬菜生产基地应运用缓冲带或物理障碍物开展相对封闭式管理，非生产工作人员、车辆等不可随意进到有机蔬菜基地单元。用于有机蔬菜生产的农机具、架材、生产设施等也要专管专用，不要被非有机生产部分的禁用物质污染。对因需要而必须进入生产区域的人员、车辆等应进行严格消毒。
二、加强检疫
植物病虫草害检疫是为防止农作物病虫草害随同农作物的产品、种子、种苗扩散而传播的一套措施，是限制人为传播病虫草害的根本途径。因此，从外部引进蔬菜种苗和其他投入品时，应严格检疫，防止检疫性病原菌和虫卵随蔬菜的种苗和其他投入品在有机蔬菜基地传播和蔓延。
三、加强病虫害的预测预报
蔬菜病虫害的发生，都有其可循的自然规律和相应的环境条件。因此，可根据蔬菜病虫害发生的规律和相应的环境，结合田间定点观测和环境条件监测情况，及时预测蔬菜病虫害发生的趋势，采取应对措施。
四、选择抗病虫品种，必要时对种子、种苗进行消毒处理
播种前，去除混杂的杂草种子和带病虫的种子。选择抗病、抗虫、抗逆且适合有机蔬菜基地土壤和环境（露地、设施等）栽培的蔬菜种类和优良品种，是有机蔬菜病虫害防治的关键，也是有机蔬菜病虫害防治最经济、最有效的方法。种植前对种子、种苗进行消毒处理，尽量减少种子、种苗带菌量或害虫的虫卵，其措施主要是利用热力、冷冻、干燥、电磁波、超声波等物理防治方法抑制、钝化或杀死病原物或害虫，达到防治病虫害的目的。特别是对气传病害、土传病害和病毒病害可以得到很好的控制。
五、深翻土地和改良土壤
深翻土地和改良土壤是改变植物土壤环境的措施，直接影响土壤中的病原物。深翻土地可将残留在地面的病残体、越冬病原物的休眠体结构，如菌核等翻入土中，加快病残体分解和腐烂，加快其病原物的死亡，或将菌核等深埋在土中后第二年失去传染作用。但是，每年耕翻，搅乱了土层，使杂草种子分布在所有耕层，杂草整体密度较大，出苗分散，不利于防治。多年生杂草较少的田地，最好用浅耕作灭茬为佳。
六、合理间（套）作
间（套）作是两种以上作物隔畦、隔行或隔株有规则栽培的种植制度，合理间（套）作影响生物群落，有利于天敌多样化，从而减少病虫害的发生。有机蔬菜间（套）作的原则如下：
1、利用生长时间差选择作物生长前期、后期或有利于蔬菜生长但不利于病虫害发生的季节间（套）作。
2、利用生长空间差选择不同高度、株型、根系深浅的作物进行间（套）作。
3、利用引起病虫害的病虫差为了避免病虫害的发生和蔓延，不宜将同科的蔬菜搭配在一起或将具相同病虫害的作物（例如生姜和番茄）进行间（套）作。
4、利用病虫发生条件生态差，综合土壤一植物一微生物三者关系，利用植物健康管理技术原理，选择适宜的作物之间作套种。
七、土壤处理或合理轮作
1、用透明的塑料薄膜覆盖在潮湿的土壤上，在晴天可以得到太阳能，提高土壤温度，杀伤土壤中的病原物；在重茬土壤中种植可以在播种前使用有效的生物制剂和矿物农药处理种子和苗木，使之免受土壤中的病原物的侵害，在现代农业中追求经济效益，长期在同一个田块中连续栽培同一种作物，使得发生连作障碍或重病植物生长受到阻碍，病害越来越重。
2、轮作是指在同一个田地上有顺序地在季节间和年度间轮流种植不同的作物或复种组合的种植方式。它能打破虫和病的发作周期，阻止杂草的滋生，同时有利于均衡利用土壤养分，有效的改善土壤的理化性状，调节土壤肥力。
