预防番茄叶霉病、斑枯病等病害，应选择温汤浸种的方法。营养土配制时施入的肥料充足，整个苗期可以不施肥。齐苗后，苗床的温度不可太高，以便幼苗生长健壮，增强耐寒性、抗病能力。苗期一般不需要浇水，必须浇水时，应选择晴天中午。不要让幼苗见光不足，不要忽视病虫害的预防。
一、种子消毒
预防番茄叶霉病、斑枯病、早疫病、溃疡病等病害，应选择温汤浸种的方法，即将种子放入55℃的热水中，边搅拌边浸种15分钟，然后在30℃的温水中浸泡4～5小时后捞出，在30℃环境中催芽。为了预防病毒疾病，可以用10%的磷酸三钠溶液浸泡20分钟，然后用清水催芽。
二、苗床土消毒
在播前床土浇水后，用72.2%的普力克水剂500~600倍液喷洒苗床，每平方米喷洒2~4公斤，或多菌灵消毒，每1000公斤床土用50%多菌灵可湿性粉剂25~30克，处理时将多菌灵配成水溶液，喷洒在床土上，拌匀后用塑料薄膜严密覆盖，一般2~3天就能杀死土壤中的枯萎病等多种病原菌。
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三、早施基肥
营养土配制时施入的肥料充足，整个苗期可以不施肥，如果发现幼苗叶片颜色变淡，出现缺肥症状时，可喷洒少许质量有保证的磷酸二氢钾500倍液。
四、温度调控适当
齐苗后，苗床的温度不可太高，以便幼苗生长健壮，增强耐寒性、抗病能力。两叶一心期间切忌苗床的保温措施跟不上，若温度持续偏低的话，花芽的分化会受到阻碍，早春落花落果会变得严重，影响早期的产量，晴天中午，苗床的温度容易偏高。此时，为了防止幼苗因温差变大而枯萎或死亡，要避免苫大通风。
五、不要使床湿度过大
苗期一般不需要浇水。必须浇水时，应选择晴天中午，浇水时应使用温水。不要浇太多水以防造成苗床过大，导致烂眼、僵苗和病害孳生。施药后，为了防止苗床湿度过大，可以撒上草木灰或细干土吸湿。
六、不要让幼苗见光不足
在幼苗越冬的阶段，经常遇到阴天，外部温度低，不少菜农不敢揭开草帘，造成幼苗多天没有见光，因营养不良而影响幼苗花菜的形成和发育。要增加光照，要经常保持覆盖物的清洁，草帘尽量早揭晚盖。阴天也要正常地揭盖草帘，尽量增加光照的时间。
七、不要忽视病虫害的预防
苗期容易发生立枯病、猝死病等。发病初期，先拔除病苗，然后及时喷药保护，防止蔓延。
八、不要不炼苗而定植
在定植前5~7天，幼苗需要有一个炼苗过程，来提高幼苗的抵抗力，适应定植后的环境。切忌不炼苗直接定植，以防定植后环境不适，造成定植后缓苗慢、死苗现象严重。
