经营者在侵犯商业机密的情况下，给受害人造成经济损失的需要承担经济损失赔偿责任。受害人的损失在难以计算的情况下，赔偿金额为侵权人在侵犯商业机密的侵权期间因为侵犯商业机密所获取的利润，并承担受害人的因为调查商业机密侵权的侵权人的合法的权利利益的不正当竞争的行为，支付合理合法的经济赔偿。
对于侵犯商业机密的受害人的直接经济损失的计算方面包括开发，研发生产的成本，商业机密的价值，经济利益的损失，侵权人的获利，商业机密转让费用等几个方面的方法
。根据不同的情况选择不同的合理标准给予刑事或民事司法认定。
直接计算经济利益损失法：即直接计算受害人在商业机密受到侵害的期间失去的利润。
生产成本计算法：审核计算受害人在研究开发保密的商业投入的费用，累计得出总金额。
许可使用费用计算法：以受害人对于商业机密与他人使用的相同的条件下的合理合情的价格来确认计算。
侵权人获得利益计算法：受害人的损失在难以计算的情况之下，可以通过逆向思维，把受害人的经济损失金额当作侵权人在侵犯商业机密的权益期间的行为获得的利润 。
对于受害人破产或者其他的重大的经济损失，在侵犯商业机密犯罪的“重大经济损失”的一个标准规定是在受害人破产或者造成其他的经济上的重大的损失。在实际上，对于受害人破产的认定，不一定是人民法院的宣告受害人的破产为标准，使得受害人在商业竞争中丧失竞争优势，受害人的企业公司处于被近倒闭停产以及停业的情况时，造成其他的经济上的严重后果的情况。
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商业机密是一种能给受害人创造经济上的价值的技术上的信息或者是经营渠道的信息，是一种无形的资产，不仅仅表现在受害人现实上和经济利益的缩减，也可能会表现在受害人预期的合理的经济利益的损失。如果单单从受害人的一方计算损失，一般通常会碰到很难计算的困难的情况。故在刑事鉴定中，一般是参照国家法律规定的的侵权人需要承担的民事经济赔偿的金额给予受害人进行经济损失补偿。
在我国的商业秘密的保护的规定中，此时是规定了行为人侵害权利人商业秘密的救济的，比如说权利人是可以向实施侵害自己的商业秘密的行为的侵权行为人索取赔偿的，但是一般赔偿的数额也是有限度的，不能超过实际的损失。
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