2021年3月28日南通机场迎来夏秋航班换季新航季，过夜飞机增至10架，15家客运航司在本场运营通航，44座国内城市，周客运航班量增至近800架次，创南通机场开航来新高。
新增航司：中国东方航空、吉祥航空、西藏航空进驻南通
1.中国东方航空
是中国三大国有骨干航空运输集团之一，拥有中国规模最大、商业和技术模式领先的互联网宽体机队。借助天合联盟，通达全球170个国家和地区的1036个目的地，每年为全球超过1.3亿旅客提供服务，旅客运输量位列全球前十，荣膺中国民航飞行安全最高奖——“飞行安全钻石奖”。
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3月28日，南通=长沙航线将正式启航，这是东航江苏分公司在南通开通的首条航线，每天一班。
去MU2875 南通-长沙，13:40—15:40。
回MU2876 长沙-南通，10:50—12:50。
2.吉祥航空
2006年9月正式开航运营，目前公司拥有78架空客A320系列客机与波音787-9梦想客机，逐步打造双机队运输体系。品牌定位为更具亲和力的航空体验提供者，已开通200余条国内、地区及亚欧目的地定期航班;2020年年运输旅客超1500万人次。
4月18日起，吉祥航空在南通新开温州-南通-大连航线，每天一班。
去HO1837 南通-大连，17:10—18:55。
回HO1838 大连-南通，20:00—22:05。
去HO1838 南通-温州，22:50—0:20。
回HO1837 温州-南通，14:55—16:10。
3.西藏航空
是中国民用航空局批准成立的国内首家高高原航空公司，于2011年7月26日正式首航。航线网络覆盖了西藏自治区内所有民航机场，开通国际及国内航线近60条，全力为旅客营造温馨、舒适的全流程乘机体验，打造具有西藏民族风情的服务特色。
3月30日起，西藏航空在南通新开南通-绵阳-拉萨航线，周246各一班。
去TV9822 南通-拉萨，15:25—21:40。
回TV9821 拉萨-南通，8:50—14:35。
去TV9822 南通-绵阳，15:25—18:25。
回TV9821 绵阳-南通，11:50—14:35。
